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雲端Imaris
Imaris 簡介
因研究與實驗之樣本對象多為3D甚至為4D立體結構, 如:細胞、組織…等。隨著科技的進步, 共軛焦顯微鏡系統以及超解析影像系統已普遍盛行, 因此獲得3D/4D影像已為大部分實驗室基本需求。所以擁有一個好的3D/4D影像展示分析軟體顯得格外重要。
Imaris ( Bitplane ) 是即時定量三維/四維/多維圖像進行視覺化和定量分析的圖像工作站,專注於多維圖像的立體展示和定量分析。Imaris提供之分析功能概述如下:
Imaris core
作為Imaris軟體家族的核心模組, 可進行多種模式影像的立體展示, 以及電影製作。可直接讀取30多種格式的檔, 幾乎涵蓋了所有顯微鏡廠家的圖像格式。提供Slice, Section, Gallery 等觀察模式, 並提供MIP 投影和混合投影模式。 |
Imaris MeasurementPro
進行幾何和強度測量, 從而得到定量結果。提供所有分析模組的分析結果數值。並可量測立體空間中, 兩點間距離, 兩條線之角度, 線所通過的每個Voxel之每個Channel強度分布。 |
Imaris Lineage/Track
3D/4D圖像動態物體自動追蹤及分析, 更可追蹤細胞繼代分析。提供多種追蹤演算法用以優化分析結果。基於物體的大小, 強度, 形狀, 速度, 運動方向, 運動曲度等多種參數實現自動追蹤。 |
lImaris Colocalization
獲得3D/4D空間共定位定量資訊, 並進行空間視圖展示。提供多種空間共定位區域的選定方法, 即時獲得共定位資料,空間共定位結果可以展示為新的Channel, 因此可進行兩個Channel以上共定位分析。 |
lImaris Filament Tracer
絲狀結構追蹤分析( 神經樹突/軸突/微管結構) 。使用全自動, 半自動, 以及手動等方法進行神經或絲狀結構示蹤。可獲得分支長度, 直徑, 體積及神經topology等眾多神經專業分析參數。 |
Imaris Cell
對每個單獨的細胞進行個體研究, 從而分析多個細胞間或者細胞內的交流狀態。可依據細胞核, 細胞質, 細包膜定義細胞結構。可分析細胞間和細胞內細胞器的關係, 並對大量的囊泡狀物體進行自動檢測和分類。 |
Imaris Vantage
採用統計數值資料與立體視圖結合展示的模式, 清晰的展現隱藏在多維圖像資料中複雜的相互關係。可將分析結果以2D-5D方式進行立體視圖展示。 |
ImarisXT
通過與其它軟體的交互使用,實現了多功能拓展, 為實驗提供更多的計算方法。流暢的與Matlab, FIJI, Python…等軟體相連結進而獲得更多元化分析功能。 |
Imaris Batch
可以自動對圖像進行批量處理。可將同樣組別的的所有圖檔, 皆可套用同樣參數自動進行, 用以節省分析圖像的時間, 快速得到最終結果。 |