顯微影像核心實驗室

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雲端Amira 

跨生命科學領域的先進生物影像分析
Amira 軟體在多種科學領域的應用。從細胞生物學、解剖生物學到神經科學、製藥與生技、結構生物學、植物生物學與生物工程,Amira 提供強大的工具,協助進行影像視覺化、分析與資料整合。
 

 

Cell Biology
Amira 軟體簡化了複雜影像數據的分析,提供超越 2D 影像的深入洞察。它能自動分離與測量 3D 中的細胞與細胞核,偵測細胞特徵、降低雜訊並提升對比度,以建立高解析度模型。

此外,軟體能自動偵測與追蹤纖維結構、重建網路,並量化如長度與厚度等參數。透過跨模態配準方法,也能進行關聯性研究,並已在多種生命科學應用中驗證其有效性。

Entire Chlamydomonas imaged under cryogenic conditions. AI Deep Learning segmentation identified various organelles.

 

Anatomical biology
Amira 軟體為生醫與製藥研究人員提供靈活且統一的框架,能無縫整合多種成像模式,並可在單一時間點或縱向研究中進行關聯性分析。該軟體廣泛應用於學術發表與高通量分析,是組織研究、大腦研究、牙科研究及其他應用的理想選擇。


它支援依研究社群指引進行的骨骼分析,並提供先進的數位體積關聯(Digital Volume Correlation, DVC),用於研究材料的變形與應變。

Amira 在大型資料集的視覺化、分割與分析方面表現優異,結合傳統與 AI 解決方案,使其成為前臨床與臨床研究影像的寶貴工具。

Trabecular bone tissue in mouse tibia analyzed with Amira Software

 

Plant biology

Amira 軟體協助植物生物學研究人員,以高精度與高效率的方式,在細胞與次細胞層級上視覺化並分析複雜的植物結構。它提供自動化流程,用於植物組織分析,包括根、莖、葉以及細胞結構。

藉由強大的分割工具與整合式 AI 解決方案,Amira 提升了數據處理的精確度與速度,超越傳統方法。它亦能整合多模態成像數據,實現不同數據類型的無縫關聯,這對於追蹤生長模式、研究細胞對環境刺激的反應,以及理解植物與微生物交互作用至關重要。

3D thylakoids and pyrenoids with Amira Software.


國立台灣大學

分子影像學重點技術平台

醫學院第一共同研究室顯微影像核心

NTU Consortium of Molecular Imaging Key Technology

Imaging Core Facility of the First Core Laboratory, College of Medicine, National Taiwan University

帳務與未繳費而造成無法預約之問題, 請洽R1405 分機288505 李學良先生

A1, M1, ApoTome, Leica SP8, LSM780使用問題, 請洽R1443柯蘊庭副技師 yuntingko@ntu.edu.tw分機288500

LSM880, TIRF/SD, LSM980 使用與影像分析問題, 請洽R1443 羅安琦副技師 anchi0714@ntu.edu.tw 分機288504

HCS, STED, FLIM, Elyra7影像實驗諮詢與影像分析問題, 請洽R1443 許紹君副研究專家 peggyschsu@ntu.edu.tw 分機288509